MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Cloacamonas acidaminovorans str. Evry provisional genome sequence from WWE1 candidate division

Total Repeats: 6906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020449	TAT	2	6	1378	1383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020449	TAT	2	6	1387	1392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020449	TAGA	2	8	1399	1406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020449	TTC	2	6	1415	1420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020449	A	7	7	1424	1430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020449	TTA	2	6	1431	1436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020449	GAA	2	6	1479	1484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020449	A	6	6	1497	1502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020449	TGGA	2	8	1531	1538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020449	TA	4	8	1550	1557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020449	TAAG	2	8	1585	1592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020449	AGAAA	2	10	1662	1671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020449	TA	3	6	1718	1723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020449	TTAA	2	8	1730	1737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020449	ATT	3	9	1744	1752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020449	GA	3	6	8137	8142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020449	TCA	2	6	12787	12792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020449	CTT	2	6	12796	12801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020449	A	6	6	12802	12807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020449	AAAT	2	8	12835	12842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020449	GGTA	2	8	12853	12860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020449	TAGA	2	8	13728	13735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020449	ATT	2	6	13777	13782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020449	T	6	6	13789	13794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020449	A	8	8	13795	13802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020449	AAC	2	6	13826	13831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020449	AG	3	6	13860	13865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020449	AAC	2	6	13914	13919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020449	AT	3	6	13987	13992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020449	T	6	6	14103	14108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020449	ATA	2	6	14118	14123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020449	AGAT	2	8	14147	14154	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020449	AT	3	6	14153	14158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020449	TA	3	6	14180	14185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020449	A	6	6	14210	14215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020449	ATT	2	6	14244	14249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020449	T	7	7	14253	14259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020449	ATAA	2	8	14271	14278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020449	AT	3	6	14283	14288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020449	AAC	2	6	14311	14316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020449	GAAG	2	8	14517	14524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020449	AAAT	2	8	14690	14697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020449	GAA	2	6	14728	14733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020449	T	7	7	14763	14769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020449	A	7	7	14803	14809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020449	AGA	3	9	14823	14831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020449	A	9	9	14844	14852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020449	AATT	2	8	16243	16250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020449	TAA	2	6	16253	16258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020449	TCA	2	6	16265	16270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020449	CT	3	6	16360	16365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020449	ATA	2	6	16367	16372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020449	TAAA	2	8	16423	16430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020449	AAGGG	2	10	16439	16448	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020449	A	8	8	16493	16500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020449	ATTTA	2	10	16505	16514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020449	AGAT	2	8	21047	21054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020449	ATT	2	6	21061	21066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020449	ATT	2	6	21114	21119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020449	ATT	2	6	21127	21132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020449	ACA	2	6	21170	21175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020449	A	6	6	21175	21180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020449	ATCT	2	8	21187	21194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020449	ACG	2	6	21226	21231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020449	ACG	2	6	21314	21319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020449	AAAG	2	8	21336	21343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020449	GTT	2	6	21351	21356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020449	ATT	2	6	21432	21437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020449	A	6	6	21554	21559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020449	A	6	6	21589	21594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020449	A	6	6	21617	21622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020449	AG	3	6	21659	21664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020449	GA	3	6	25022	25027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020449	AAT	2	6	25055	25060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020449	A	7	7	25105	25111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020449	AAGA	2	8	25169	25176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020449	GA	3	6	25175	25180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020449	GGA	2	6	29971	29976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020449	TAACA	2	10	30614	30623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_020449	GAAG	2	8	30651	30658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020449	TAA	2	6	33533	33538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020449	CAATA	2	10	33552	33561	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020449	ATT	2	6	33566	33571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020449	TAAA	2	8	33596	33603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020449	TCT	2	6	33614	33619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020449	ATTGC	2	10	33626	33635	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020449	CAGG	2	8	33697	33704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020449	AAAT	2	8	33705	33712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020449	AT	3	6	33748	33753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020449	TAT	3	9	33751	33759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020449	CTG	2	6	33788	33793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020449	ATA	2	6	33809	33814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020449	T	6	6	33852	33857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020449	A	7	7	33906	33912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020449	ATA	2	6	34451	34456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020449	TTCT	2	8	34483	34490	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020449	CT	3	6	34534	34539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020449	GGA	2	6	36607	36612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020449	ACT	2	6	36622	36627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020449	A	7	7	36652	36658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020449	CAT	2	6	36708	36713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020449	AGGAA	2	10	36742	36751	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020449	A	7	7	36750	36756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020449	A	6	6	36758	36763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020449	CCA	2	6	36796	36801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_020449	TTC	2	6	36936	36941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020449	A	6	6	37049	37054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020449	T	6	6	37522	37527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020449	TAT	2	6	37553	37558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020449	AT	3	6	37585	37590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020449	TAA	2	6	38490	38495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020449	GAT	2	6	46011	46016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020449	ATC	2	6	46033	46038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020449	CTTTTT	2	12	46059	46070	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_020449	TCCT	2	8	46440	46447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020449	ATC	3	9	46507	46515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020449	A	7	7	47275	47281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020449	TA	3	6	49139	49144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020449	A	7	7	50471	50477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020449	TGG	2	6	50549	50554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020449	A	6	6	50570	50575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020449	CT	3	6	50586	50591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020449	ATC	2	6	50595	50600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020449	GAA	2	6	50668	50673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020449	T	6	6	50686	50691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020449	ATG	2	6	50735	50740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020449	TAT	2	6	50873	50878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020449	AT	3	6	50887	50892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020449	ATT	2	6	50915	50920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020449	TTA	2	6	50921	50926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020449	AAC	3	9	50941	50949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020449	CTTT	2	8	50960	50967	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020449	CAT	2	6	50985	50990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020449	AC	3	6	50995	51000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020449	ATT	2	6	51006	51011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020449	TAT	2	6	51026	51031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020449	TTC	2	6	51045	51050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020449	GAA	2	6	51134	51139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020449	T	7	7	51142	51148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020449	AT	3	6	51232	51237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020449	GTC	2	6	51326	51331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020449	CTCTTT	2	12	51341	51352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_020449	A	6	6	51446	51451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020449	ATTA	2	8	51453	51460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020449	A	6	6	51485	51490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020449	CAA	2	6	51554	51559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_020449	T	7	7	51591	51597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020449	AAC	2	6	51616	51621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_020449	GGTC	2	8	53017	53024	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_020449	A	6	6	53051	53056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020449	TCT	2	6	53067	53072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_020449	GGA	2	6	53170	53175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020449	CCG	2	6	53210	53215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_020449	TCC	2	6	53246	53251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_020449	A	6	6	53270	53275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020449	GT	3	6	53323	53328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020449	A	7	7	53378	53384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020449	GCA	2	6	53411	53416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_020449	TCCT	2	8	53447	53454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_020449	GTC	2	6	53485	53490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_020449	CCAG	2	8	53546	53553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_020449	A	6	6	53560	53565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020449	CTT	2	6	53616	53621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_020449	A	6	6	53680	53685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020449	GA	3	6	53708	53713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_020449	AT	3	6	57022	57027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020449	AAC	2	6	58363	58368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_020449	T	6	6	58502	58507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_020449	CT	3	6	58528	58533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
170	NC_020449	CAT	2	6	58541	58546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_020449	GAG	2	6	58577	58582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_020449	TAAAA	2	10	58609	58618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_020449	AAAT	2	8	60644	60651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_020449	TCT	2	6	61143	61148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_020449	GA	3	6	62216	62221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_020449	AGA	2	6	62282	62287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_020449	TAC	2	6	62289	62294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_020449	CT	3	6	62301	62306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
180	NC_020449	ATTT	2	8	62307	62314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_020449	T	6	6	62346	62351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020449	TCC	2	6	62393	62398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_020449	T	6	6	65645	65650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_020449	T	8	8	65702	65709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_020449	AG	3	6	65776	65781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_020449	CAC	2	6	65789	65794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
189	NC_020449	AAT	2	6	65799	65804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_020449	TC	3	6	65813	65818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
191	NC_020449	AT	3	6	65841	65846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_020449	GGAAA	2	10	65891	65900	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_020449	T	6	6	65916	65921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_020449	CTTT	2	8	66275	66282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
199	NC_020449	CTT	2	6	66289	66294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
200	NC_020449	ATC	2	6	66305	66310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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239	NC_020449	TAA	2	6	81497	81502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_020449	TAAAAA	2	12	87378	87389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_020449	CCA	2	6	89105	89110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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278	NC_020449	TAC	2	6	89294	89299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_020449	TAT	2	6	89301	89306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_020449	CAAC	2	8	89328	89335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
281	NC_020449	A	6	6	89362	89367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020449	AAT	2	6	89370	89375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020449	AAG	2	6	89382	89387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020449	AAAATA	2	12	90035	90046	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_020449	T	7	7	95869	95875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_020449	AT	3	6	99291	99296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020449	ATTT	2	8	100611	100618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_020449	T	7	7	100648	100654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_020449	TTA	2	6	100676	100681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_020449	T	6	6	100715	100720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_020449	AATAA	2	10	100756	100765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_020449	GAAATG	2	12	100769	100780	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_020449	CAT	2	6	100824	100829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_020449	GAA	2	6	133044	133049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_020449	TA	3	6	152188	152193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_020449	ACAA	2	8	152250	152257	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

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